Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LEMD3Q9Y2U8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LEMD3Q9Y2U8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LEMD3Q9Y2U8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms