Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.82■■■■■ 6.85
NISCHQ9Y2I1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC57.81■■■■■ 6.85
NISCHQ9Y2I1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.81■■■■■ 6.84
NISCHQ9Y2I1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC57.8■■■■■ 6.84
NISCHQ9Y2I1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC57.79■■■■■ 6.84
NISCHQ9Y2I1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.78■■■■■ 6.84
NISCHQ9Y2I1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC57.78■■■■■ 6.84
NISCHQ9Y2I1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC57.77■■■■■ 6.84
NISCHQ9Y2I1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.77■■■■■ 6.84
NISCHQ9Y2I1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.76■■■■■ 6.84
NISCHQ9Y2I1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC57.76■■■■■ 6.84
NISCHQ9Y2I1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC57.76■■■■■ 6.84
NISCHQ9Y2I1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC57.75■■■■■ 6.83
NISCHQ9Y2I1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC57.75■■■■■ 6.83
NISCHQ9Y2I1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC57.74■■■■■ 6.83
NISCHQ9Y2I1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC57.74■■■■■ 6.83
NISCHQ9Y2I1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC57.73■■■■■ 6.83
NISCHQ9Y2I1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC57.73■■■■■ 6.83
NISCHQ9Y2I1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC57.73■■■■■ 6.83
NISCHQ9Y2I1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC57.73■■■■■ 6.83
NISCHQ9Y2I1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC57.72■■■■■ 6.83
NISCHQ9Y2I1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC57.71■■■■■ 6.83
NISCHQ9Y2I1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC57.71■■■■■ 6.83
NISCHQ9Y2I1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.7■■■■■ 6.83
NISCHQ9Y2I1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.7■■■■■ 6.83
NISCHQ9Y2I1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.69■■■■■ 6.83
NISCHQ9Y2I1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC57.69■■■■■ 6.83
NISCHQ9Y2I1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC57.68■■■■■ 6.82
NISCHQ9Y2I1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC57.68■■■■■ 6.82
NISCHQ9Y2I1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.67■■■■■ 6.82
NISCHQ9Y2I1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC57.67■■■■■ 6.82
NISCHQ9Y2I1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC57.67■■■■■ 6.82
NISCHQ9Y2I1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC57.67■■■■■ 6.82
NISCHQ9Y2I1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.66■■■■■ 6.82
NISCHQ9Y2I1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.66■■■■■ 6.82
NISCHQ9Y2I1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC57.66■■■■■ 6.82
NISCHQ9Y2I1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC57.64■■■■■ 6.82
NISCHQ9Y2I1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC57.64■■■■■ 6.82
NISCHQ9Y2I1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC57.63■■■■■ 6.82
NISCHQ9Y2I1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC57.63■■■■■ 6.82
NISCHQ9Y2I1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC57.63■■■■■ 6.82
NISCHQ9Y2I1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC57.61■■■■■ 6.81
NISCHQ9Y2I1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.61■■■■■ 6.81
NISCHQ9Y2I1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.6■■■■■ 6.81
NISCHQ9Y2I1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.59■■■■■ 6.81
NISCHQ9Y2I1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC57.59■■■■■ 6.81
NISCHQ9Y2I1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC57.58■■■■■ 6.81
NISCHQ9Y2I1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.58■■■■■ 6.81
NISCHQ9Y2I1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC57.58■■■■■ 6.81
NISCHQ9Y2I1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC57.56■■■■■ 6.81
NISCHQ9Y2I1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC57.56■■■■■ 6.81
NISCHQ9Y2I1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.56■■■■■ 6.81
NISCHQ9Y2I1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC57.56■■■■■ 6.81
NISCHQ9Y2I1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC57.56■■■■■ 6.81
NISCHQ9Y2I1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC57.55■■■■■ 6.8
NISCHQ9Y2I1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC57.55■■■■■ 6.8
NISCHQ9Y2I1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.54■■■■■ 6.8
NISCHQ9Y2I1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC57.54■■■■■ 6.8
NISCHQ9Y2I1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC57.54■■■■■ 6.8
NISCHQ9Y2I1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.53■■■■■ 6.8
NISCHQ9Y2I1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC57.53■■■■■ 6.8
NISCHQ9Y2I1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.51■■■■■ 6.8
NISCHQ9Y2I1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC57.51■■■■■ 6.8
NISCHQ9Y2I1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.5■■■■■ 6.8
NISCHQ9Y2I1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC57.5■■■■■ 6.8
NISCHQ9Y2I1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC57.5■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC57.49■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC57.48■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.48■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.48■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC57.48■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC57.48■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.47■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC57.47■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.47■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.46■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.46■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC57.45■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.45■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC57.45■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC57.45■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.45■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC57.44■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC57.44■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC57.44■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC57.44■■■■■ 6.79
NISCHQ9Y2I1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC57.43■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC57.43■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.42■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC57.42■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC57.41■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC57.4■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC57.4■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC57.4■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC57.4■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC57.4■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC57.4■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC57.4■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC57.4■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC57.4■■■■■ 6.78
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