Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPC6Q9Y210 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPC6Q9Y210 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRPC6Q9Y210 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRPC6Q9Y210 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPC6Q9Y210 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms