Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN88

GABRQ, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRQQ9UN88 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GABRQQ9UN88 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABRQQ9UN88 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABRQQ9UN88 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GABRQQ9UN88 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms