Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCDHA12Q9UN75 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHA12Q9UN75 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHA12Q9UN75 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms