Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNPO2Q9UMS6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNPO2Q9UMS6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNPO2Q9UMS6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms