Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNMA8BQ9ULN7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA8BQ9ULN7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms