Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
INO80Q9ULG1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
INO80Q9ULG1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
INO80Q9ULG1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
INO80Q9ULG1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
INO80Q9ULG1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
INO80Q9ULG1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
INO80Q9ULG1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
INO80Q9ULG1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
INO80Q9ULG1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
INO80Q9ULG1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
INO80Q9ULG1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
INO80Q9ULG1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
INO80Q9ULG1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
INO80Q9ULG1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
INO80Q9ULG1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
INO80Q9ULG1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
INO80Q9ULG1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
INO80Q9ULG1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
INO80Q9ULG1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
INO80Q9ULG1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
INO80Q9ULG1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
INO80Q9ULG1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
INO80Q9ULG1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
INO80Q9ULG1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
INO80Q9ULG1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
INO80Q9ULG1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
INO80Q9ULG1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms