Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC13A4Q9UKG4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A4Q9UKG4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms