Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC23Q9UJX2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDC23Q9UJX2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC23Q9UJX2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.5 ms