Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSRAQ9UJ68 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSRAQ9UJ68 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSRAQ9UJ68 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms