Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CPA4Q9UI42 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPA4Q9UI42 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPA4Q9UI42 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms