Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT8Q9UFF9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT8Q9UFF9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms