Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC6Q9UBN7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDAC6Q9UBN7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC6Q9UBN7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms