Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPG2Q9UBF2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPG2Q9UBF2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms