Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC45.26■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
CC2D2AQ9P2K1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC45.24■■■■■ 4.83
CC2D2AQ9P2K1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
CC2D2AQ9P2K1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.23■■■■■ 4.83
CC2D2AQ9P2K1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
CC2D2AQ9P2K1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
CC2D2AQ9P2K1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
CC2D2AQ9P2K1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
CC2D2AQ9P2K1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
CC2D2AQ9P2K1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
CC2D2AQ9P2K1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CC2D2AQ9P2K1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
CC2D2AQ9P2K1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
CC2D2AQ9P2K1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
CC2D2AQ9P2K1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC45.19■■■■■ 4.83
CC2D2AQ9P2K1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.83
CC2D2AQ9P2K1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
CC2D2AQ9P2K1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
CC2D2AQ9P2K1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC45.18■■■■■ 4.82
CC2D2AQ9P2K1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC45.18■■■■■ 4.82
CC2D2AQ9P2K1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
CC2D2AQ9P2K1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
CC2D2AQ9P2K1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
CC2D2AQ9P2K1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
CC2D2AQ9P2K1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
CC2D2AQ9P2K1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
CC2D2AQ9P2K1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
CC2D2AQ9P2K1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
CC2D2AQ9P2K1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC45.1■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
CC2D2AQ9P2K1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC45.07■■■■■ 4.8
CC2D2AQ9P2K1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC45.05■■■■■ 4.8
CC2D2AQ9P2K1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
CC2D2AQ9P2K1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
CC2D2AQ9P2K1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CC2D2AQ9P2K1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CC2D2AQ9P2K1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CC2D2AQ9P2K1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CC2D2AQ9P2K1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CC2D2AQ9P2K1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CC2D2AQ9P2K1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CC2D2AQ9P2K1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
CC2D2AQ9P2K1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
CC2D2AQ9P2K1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
CC2D2AQ9P2K1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
CC2D2AQ9P2K1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
CC2D2AQ9P2K1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC45■■■■■ 4.79
CC2D2AQ9P2K1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC45■■■■■ 4.79
CC2D2AQ9P2K1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
CC2D2AQ9P2K1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
CC2D2AQ9P2K1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
CC2D2AQ9P2K1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC44.97■■■■■ 4.79
CC2D2AQ9P2K1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
CC2D2AQ9P2K1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
CC2D2AQ9P2K1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC44.96■■■■■ 4.79
CC2D2AQ9P2K1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
CC2D2AQ9P2K1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC44.96■■■■■ 4.79
CC2D2AQ9P2K1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
CC2D2AQ9P2K1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.79
CC2D2AQ9P2K1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC44.94■■■■■ 4.79
CC2D2AQ9P2K1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC44.93■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms