Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDE1Q9NXR1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms