Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM28Q9NW13 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM28Q9NW13 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM28Q9NW13 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM28Q9NW13 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279.8 ms