Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU7

SDAD1, Protein SDA1 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDAD1Q9NVU7 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 31.3
SDAD1Q9NVU7 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 31.3
SDAD1Q9NVU7 GOLGA4-207ENST00000437131 6947 ntTSL 1 (best)2.54□□□□□ -23e-7■■■■■ 31.3
SDAD1Q9NVU7 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 224.41■■□□□ 1.55e-8■■■■■ 31.2
SDAD1Q9NVU7 CAPN15-207ENST00000568988 911 ntTSL 324.41■■□□□ 1.55e-8■■■■■ 31.2
SDAD1Q9NVU7 CAPN15-205ENST00000567216 3174 ntTSL 1 (best)20.53■□□□□ 0.885e-8■■■■■ 31.2
SDAD1Q9NVU7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.555e-8■■■■■ 31.2
SDAD1Q9NVU7 FNDC3B-211ENST00000490832 772 ntTSL 46.88□□□□□ -1.317e-7■■■■■ 31.2
SDAD1Q9NVU7 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)21.61■■□□□ 1.057e-7■■■■■ 31.1
SDAD1Q9NVU7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.527e-7■■■■■ 31.1
SDAD1Q9NVU7 ALDOC-203ENST00000395321 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.567e-7■■■■■ 31.1
SDAD1Q9NVU7 ALDOC-202ENST00000395319 1519 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.577e-7■■■■■ 31.1
SDAD1Q9NVU7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 30.9
SDAD1Q9NVU7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.515e-7■■■■■ 30.9
SDAD1Q9NVU7 HNRNPL-212ENST00000601449 1918 ntTSL 517■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 30.9
SDAD1Q9NVU7 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.325e-7■■■■■ 30.9
SDAD1Q9NVU7 HNRNPL-202ENST00000388749 1952 ntTSL 511.09□□□□□ -0.635e-7■■■■■ 30.9
SDAD1Q9NVU7 SUN1-222ENST00000457861 2975 ntTSL 216.89■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 30.8
SDAD1Q9NVU7 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.225e-9■■■■■ 30.8
SDAD1Q9NVU7 ERBB3-209ENST00000549282 561 ntTSL 413.19□□□□□ -0.35e-9■■■■■ 30.8
SDAD1Q9NVU7 FNIP2-201ENST00000264433 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.435e-8■■■■■ 30.8
SDAD1Q9NVU7 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 30.8
SDAD1Q9NVU7 PHF8-206ENST00000413386 580 ntTSL 34.26□□□□□ -1.735e-9■■■■■ 30.8
SDAD1Q9NVU7 PHF8-213ENST00000448003 403 ntTSL 33.7□□□□□ -1.825e-9■■■■■ 30.8
SDAD1Q9NVU7 PKP4-205ENST00000426248 4134 ntTSL 1 (best)16.88■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 30.8
SDAD1Q9NVU7 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 30.8
SDAD1Q9NVU7 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 30.8
SDAD1Q9NVU7 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 30.8
SDAD1Q9NVU7 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 213.93□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 30.8
SDAD1Q9NVU7 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 313.63□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 30.8
SDAD1Q9NVU7 SEMA4G-211ENST00000521006 4656 ntTSL 1 (best)14.48□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 30.7
SDAD1Q9NVU7 SEMA4G-205ENST00000517724 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 30.7
SDAD1Q9NVU7 SEMA4G-202ENST00000370250 3596 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 30.7
SDAD1Q9NVU7 SEMA4G-201ENST00000210633 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 30.7
SDAD1Q9NVU7 TIMELESS-203ENST00000553532 5121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 30.7
SDAD1Q9NVU7 TIMELESS-201ENST00000229201 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 30.7
SDAD1Q9NVU7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 30.4
SDAD1Q9NVU7 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.337e-8■■■■■ 30.4
SDAD1Q9NVU7 WDR27-202ENST00000441385 683 ntTSL 311.24□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 30.4
SDAD1Q9NVU7 WDR27-205ENST00000467418 947 ntTSL 59.58□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 30.4
SDAD1Q9NVU7 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -02e-7■■■■■ 30.3
SDAD1Q9NVU7 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 30.3
SDAD1Q9NVU7 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 216.33■□□□□ 0.211e-8■■■■■ 30.3
SDAD1Q9NVU7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.171e-8■■■■■ 30.3
SDAD1Q9NVU7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.117e-8■■■■■ 30.3
SDAD1Q9NVU7 USP7-219ENST00000569230 569 ntTSL 54.89□□□□□ -1.636e-15■■■■■ 30.3
SDAD1Q9NVU7 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 30.2
SDAD1Q9NVU7 CHD2-205ENST00000625662 5127 ntTSL 512.46□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 30.1
SDAD1Q9NVU7 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 30
SDAD1Q9NVU7 AGO2-209ENST00000523609 3050 ntTSL 1 (best)12.02□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 30
SDAD1Q9NVU7 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.424e-7■■■■■ 30
SDAD1Q9NVU7 FLNA-208ENST00000438732 696 ntTSL 516.01■□□□□ 0.154e-13■■■■■ 30
SDAD1Q9NVU7 FLNA-214ENST00000474072 430 ntTSL 215.73■□□□□ 0.114e-13■■■■■ 30
SDAD1Q9NVU7 SPPL2B-213ENST00000621568 1017 ntTSL 516.66■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 29.8
SDAD1Q9NVU7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 29.8
SDAD1Q9NVU7 SPPL2B-208ENST00000612623 495 ntTSL 515.4■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 29.8
SDAD1Q9NVU7 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 29.8
SDAD1Q9NVU7 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.196e-6■■■■■ 29.7
SDAD1Q9NVU7 ZNF460-201ENST00000360338 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.566e-6■■■■■ 29.7
SDAD1Q9NVU7 MAPK8IP3-211ENST00000567352 507 ntTSL 212.77□□□□□ -0.378e-7■■■■■ 29.6
SDAD1Q9NVU7 ATP11A-210ENST00000471555 5786 ntTSL 1 (best)12.65□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 29.6
SDAD1Q9NVU7 ATP11A-213ENST00000489577 383 ntTSL 510.57□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 29.6
SDAD1Q9NVU7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.356e-8■■■■■ 29.5
SDAD1Q9NVU7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.16e-8■■■■■ 29.5
SDAD1Q9NVU7 RPN1-206ENST00000495462 566 ntTSL 35.87□□□□□ -1.476e-8■■■■■ 29.5
SDAD1Q9NVU7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.55e-10■■■■■ 29.5
SDAD1Q9NVU7 STXBP3-202ENST00000469338 294 ntTSL 216.46■□□□□ 0.235e-10■■■■■ 29.5
SDAD1Q9NVU7 STXBP3-204ENST00000483586 561 ntTSL 215.67■□□□□ 0.15e-10■■■■■ 29.5
SDAD1Q9NVU7 THAP9-AS1-207ENST00000507660 550 ntTSL 39.55□□□□□ -0.888e-8■■■■■ 29.5
SDAD1Q9NVU7 THAP9-AS1-212ENST00000513581 683 ntTSL 29.25□□□□□ -0.938e-8■■■■■ 29.5
SDAD1Q9NVU7 THAP9-AS1-206ENST00000505028 552 ntTSL 46.46□□□□□ -1.388e-8■■■■■ 29.5
SDAD1Q9NVU7 THAP9-AS1-203ENST00000504718 573 ntTSL 46.05□□□□□ -1.448e-8■■■■■ 29.5
SDAD1Q9NVU7 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.227e-8■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.227e-8■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.337e-8■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.47e-8■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.447e-8■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.447e-8■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.447e-8■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.567e-8■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 GTF3C1-211ENST00000569653 897 ntTSL 212.68□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 GTF3C1-204ENST00000564664 933 ntTSL 511.31□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 GTF3C1-209ENST00000568569 540 ntTSL 510.82□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 GTF3C1-212ENST00000570129 505 ntTSL 58.97□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 LPCAT1-205ENST00000513757 547 ntTSL 48.98□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 AARS-204ENST00000566969 610 ntTSL 29.31□□□□□ -0.922e-12■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 HGD-210ENST00000494453 683 ntTSL 35.13□□□□□ -1.595e-12■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.61□□□□□ -1.672e-12■■■■■ 29.4
SDAD1Q9NVU7 ROBO1-211ENST00000498428 3566 ntTSL 27.71□□□□□ -1.183e-7■■■■■ 29.3
SDAD1Q9NVU7 LGALS3BP-206ENST00000587310 768 ntTSL 215.37■□□□□ 0.055e-10■■■■■ 29.3
SDAD1Q9NVU7 LGALS3BP-215ENST00000589775 893 ntTSL 314.65□□□□□ -0.065e-10■■■■■ 29.3
SDAD1Q9NVU7 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.275e-10■■■■■ 29.3
SDAD1Q9NVU7 LGALS3BP-214ENST00000589527 818 ntTSL 313.35□□□□□ -0.275e-10■■■■■ 29.3
SDAD1Q9NVU7 LGALS3BP-211ENST00000588587 1020 ntTSL 513.31□□□□□ -0.285e-10■■■■■ 29.3
SDAD1Q9NVU7 LGALS3BP-208ENST00000588198 1132 ntTSL 212.76□□□□□ -0.375e-10■■■■■ 29.3
SDAD1Q9NVU7 LGALS3BP-216ENST00000589906 540 ntTSL 312.42□□□□□ -0.425e-10■■■■■ 29.3
SDAD1Q9NVU7 LGALS3BP-219ENST00000592255 556 ntTSL 211.51□□□□□ -0.575e-10■■■■■ 29.3
SDAD1Q9NVU7 MTHFD1L-202ENST00000367308 996 ntTSL 516.09■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 29.2
Retrieved 100 of 11,671 protein–RNA pairs in 232.3 ms