Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00846Q9NV44 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00846Q9NV44 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00846Q9NV44 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms