Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCND1Q9NSA2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND1Q9NSA2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KCND1Q9NSA2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms