Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX15Q9NRS6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX15Q9NRS6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX15Q9NRS6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX15Q9NRS6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX15Q9NRS6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX15Q9NRS6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX15Q9NRS6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX15Q9NRS6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX15Q9NRS6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX15Q9NRS6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms