Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAPOLBQ9NRJ5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPOLBQ9NRJ5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms