Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
DUOX2Q9NRD8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
DUOX2Q9NRD8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
DUOX2Q9NRD8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
DUOX2Q9NRD8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.8 ms