Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIX2Q9NPC8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIX2Q9NPC8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIX2Q9NPC8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms