Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MID1IP1Q9NPA3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MID1IP1Q9NPA3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MID1IP1Q9NPA3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MID1IP1Q9NPA3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID1IP1Q9NPA3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID1IP1Q9NPA3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID1IP1Q9NPA3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID1IP1Q9NPA3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID1IP1Q9NPA3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID1IP1Q9NPA3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID1IP1Q9NPA3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID1IP1Q9NPA3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MID1IP1Q9NPA3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID1IP1Q9NPA3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID1IP1Q9NPA3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID1IP1Q9NPA3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID1IP1Q9NPA3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID1IP1Q9NPA3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms