Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC40A1Q9NP59 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC40A1Q9NP59 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms