Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFRA4Q9GZZ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA4Q9GZZ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms