Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF7Q9BWX1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF7Q9BWX1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms