Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD2AQ9BW72 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms