Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP85Q9BW27 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP85Q9BW27 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP85Q9BW27 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP85Q9BW27 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms