Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG101Q9BSB4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1419.3 ms