Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH2D3AQ9BRG2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH2D3AQ9BRG2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms