Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VPS25Q9BRG1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms