Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3GL1Q99961 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL1Q99961 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms