Protein–RNA interactions for Protein: Q96NX9

DACH2, Dachshund homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DACH2Q96NX9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DACH2Q96NX9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DACH2Q96NX9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DACH2Q96NX9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DACH2Q96NX9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DACH2Q96NX9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DACH2Q96NX9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DACH2Q96NX9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DACH2Q96NX9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DACH2Q96NX9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms