Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf48Q96LS8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf48Q96LS8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf48Q96LS8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf48Q96LS8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf48Q96LS8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf48Q96LS8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf48Q96LS8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf48Q96LS8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf48Q96LS8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf48Q96LS8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf48Q96LS8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf48Q96LS8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf48Q96LS8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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