Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C12orf42Q96LP6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C12orf42Q96LP6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C12orf42Q96LP6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms