Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM47Q96LD4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM47Q96LD4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM47Q96LD4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms