Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPNS2Q96L46 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPNS2Q96L46 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms