Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PRAC1Q96KF2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms