Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP6Q96FZ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP6Q96FZ7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms