Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM12Q96EX1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms