Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTERF3Q96E29 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms