Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TM4SF19Q96DZ7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF19Q96DZ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms