Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PGBD4Q96DM1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PGBD4Q96DM1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms