Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF18Q96CE8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms