Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
PRG4Q92954 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PRG4Q92954 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PRG4Q92954 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PRG4Q92954 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
PRG4Q92954 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PRG4Q92954 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
PRG4Q92954 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PRG4Q92954 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.72■■■■□ 3.95
PRG4Q92954 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PRG4Q92954 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PRG4Q92954 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PRG4Q92954 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PRG4Q92954 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.95
PRG4Q92954 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PRG4Q92954 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
PRG4Q92954 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PRG4Q92954 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PRG4Q92954 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PRG4Q92954 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PRG4Q92954 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PRG4Q92954 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PRG4Q92954 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
PRG4Q92954 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PRG4Q92954 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
PRG4Q92954 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
PRG4Q92954 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PRG4Q92954 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PRG4Q92954 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
PRG4Q92954 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
PRG4Q92954 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC39.57■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.55■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
PRG4Q92954 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PRG4Q92954 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms