Protein–RNA interactions for Protein: Q92841

DDX17, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX17Q92841 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DDX17Q92841 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DDX17Q92841 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
DDX17Q92841 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.82■■■■□ 3
DDX17Q92841 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
DDX17Q92841 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
DDX17Q92841 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DDX17Q92841 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DDX17Q92841 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
DDX17Q92841 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
DDX17Q92841 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DDX17Q92841 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.8■■■■□ 3
DDX17Q92841 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.8■■■■□ 3
DDX17Q92841 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DDX17Q92841 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DDX17Q92841 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DDX17Q92841 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DDX17Q92841 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DDX17Q92841 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DDX17Q92841 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DDX17Q92841 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
DDX17Q92841 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.79■■■■□ 3
DDX17Q92841 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
DDX17Q92841 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DDX17Q92841 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
DDX17Q92841 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DDX17Q92841 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DDX17Q92841 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DDX17Q92841 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DDX17Q92841 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
DDX17Q92841 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DDX17Q92841 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
DDX17Q92841 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
DDX17Q92841 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
DDX17Q92841 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
DDX17Q92841 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
DDX17Q92841 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
DDX17Q92841 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
DDX17Q92841 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
DDX17Q92841 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms