Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY36

BBX, HMG box transcription factor BBX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBXQ8WY36 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBXQ8WY36 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBXQ8WY36 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBXQ8WY36 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.8 ms